省内分布有黑龙江、松花江、乌苏里江、绥芬河4大水系。黑龙江省是湿地资源大省，在由于建国初期至上世纪90年代中期，多次大规模开垦殖湿地发展农业生产活动，超强度利用湿地资源，使三江平原破碎化、岛屿化，挖沟筑坝减少湿地生态用水，引起造成一系列生态环境问题。为尽快恢复湿地资源，改善湿地生态环境，维护湿地生物多样性，省林业行政主管部门在省委、省政府领导下，把湿地保护工作列入重要日程，组织实施湿地保护规划建设工程项目，使黑龙江省湿地保护工作走上了依法保护、科学规划、逐步恢复的轨道。

    全省国家级和省级自然保护区在开展基础设施建设的同时，积极开展湿地恢复工作。兴凯湖国家级自然保护区有计划在中俄边境松阿察河口附近弃耕还湿1万亩；三环泡省级自然保护区修建滚水坝提高湿地水位60厘米，增加明水面积10.5万亩，退耕还湿1.5万亩；绥滨两江湿地自然保护区禁止放牧，恢复湿地原始景观。全省在财力有限的情况下，优先在兴凯湖、安邦河、七星河、挠力河、三江、三环泡等自然保护区有计划开展了退耕还湿6.75万亩，如安邦河自然保护区在低洼耕地修筑大网格堤坝，通过补水种植芦苇，恢复湿地18000亩；七星河自然保护区与农民签订退耕还湿合同，退耕还湿7000亩。扎龙国家级自然保护区分从2002年开始，连续引嫩江水为湿地补水，累计补水量达7亿立方米，使扎龙湿地得到较好的恢复。大庆市政府通过净化生活污水为龙凤湿地补水，有效地缓解了水资源短缺的问题。洪河国家级自然保护区通过湿地保护工程项目修建滚水坝为湿地补水。

    通过十年的不懈努力，湿地生态环境不断改善，湿地生物多样性得到有效维护，使湿地指示鸟类有了恢复性的增长，丹顶鹤数量由十年前的500多只增加到现在的700多只，洪河自然保护区白鹳数量由2000年的20只增加到现在的60多只。在安邦河、龙凤、三环泡自然保护区，人们可以随处看到成群的野鸭、白鹭等水禽，成为当地知名的生态建设窗口和旅游景点。扎龙、安邦河等自然保护区积极开展湿地生态旅游，获得了较好的经济效益。